PCR引物是一种用于扩增DNA靶标的短片段，而PCR引物的二聚体是引物序列中相邻的两个小片段的配对。而引物二聚体的合适性是PCR检测的关键。二聚体太短可能导致引物与非特异性靶标形成复合物。反之，过长的二聚体则可能会影响引物与靶标的匹配度。因此，引物二聚体长度通常在15到25 bp之间，而二聚体内的GC含量应该为50％左右，以确保引物在适当的温度下粘合。在引物设计中，需要注意以下细节：
- 引物长度应适宜，过长过短都不好。长度为15-25bp。
- 长度相同的引物对应的长度相同的DNA片段，因此引物的长度要相等。
- 引物的末端尽量避免配对含有连锁不稳定区和棘突。
- 避免某些二聚体“特异性”，如A/T结构。
- 尽量避免引物中的GC和AT含量低于30%的情况。
- 引物二聚体应该避免生成自我们不需要扩增的部位上。
引物二聚体是PCR技术中的核心，因此良好的引物设计和二聚体的优化至关重要，能够提高PCR扩增的特异性和灵敏度。同时，根据不同实验的需要，我们还可以在引物二聚体上做文章，例如添加脱氧核糖双核苷酸，添加荧光标记等，这些操作能够让PCR技术的应用更加精细化和多样化。
